grep / sed 예문:

• grep "CA" porin.pdb (C altha 원자만 골라 낼때)
• grep "CA" porin.pdb > CA.pdb (파일로 저장)
• grep "CA" porin.pdb | grep "ALA" (C altha 원자만 골라 낸 후 Ala 데이터만 원할때, 즉 다중 검색가능)

• sed /LYS/d pro.pdb (LYS 을 포함한 열을 모두 지울때)
• sed /LYS/d pro.pdb > pro2.pdb (파일로 저장)
• sed s/LYS/ARG/ pro.pdb (LYS 을 ARG으로 모두 치활할때)